生殖医学中心，主要研究方向为四个亚学科：男、女不孕不育诊疗、人类辅助生殖及其衍生技术、生殖内分泌疾病诊治、复发性流产诊治。
生殖医学中心2000年开始开展人类辅助生殖技术，系合肥市生殖医学研究中心、合肥市医学重点学科、合肥市辅助生殖质控中心挂靠单位，安徽医科大学临床检验诊断学、妇产科学硕士研究生培养点，获得国家级“巾帼文明岗”荣誉称号。目前该团队共有39人，其中高级职称9人、中级职称14人，博士研究生3人、硕士研究生16人。并承担多项省市级科研课题，其中省、市级重大科研项目各一项，获得省级科技进步奖2项，市级科技进步奖4项，拥有国家发明专利5项，实用新型专利11项，多次成功举办国家级、省市级继续教育学习班，发表专业学术论文100多篇。目前试管婴儿妊娠成功率较高，本中心获得成功妊娠并足月分娩的患者最大年龄为50周岁，对不孕不育疑难病例、反复流产、卵巢功能减退等不孕不育患者，采取个体化诊疗方案并获得了满意的临床效果，具有相当丰富的临床经验。
      多项填补我市“试管婴儿”技术的空白：2001年4月，诞生第一例体外受精（IVF）“试管婴儿”；2001年5月，诞生第一例囊胚培养“试管婴儿”；2001年8月，诞生第一例卵胞浆内单精子注射（ICSI）“试管婴儿”；2001年8月，诞生第一例输卵管内胚胎移植“试管婴儿”；2001年8月，诞生第一例经阴输卵管内胚胎移植“试管婴儿”；2001年12月，诞生第一例多胎妊娠减胎“试管婴儿”；2008年12月，诞生第一例冷冻胚胎移植“试管婴儿”；2014年9月，诞生激光辅助胚胎孵出“试管婴儿”；2015年3月，诞生第一例人类卵子玻璃化冷冻解冻“试管婴儿”。
生殖医学中心主要开展以下业务工作：
一、男、女不孕不育诊治
1.进行各种女性不孕症的诊断和系统治疗
2.输卵管检查与治疗
3.宫腔镜检查及输卵管梗阻的介入疏通治疗
4.男性精液系统性检查
5.男性不育症系统性治疗
二、人类辅助生殖及其衍生技术
1.夫精宫腔内人工授精治疗
2.各种“试管婴儿”技术的治疗
体外受精—胚胎移植技术（IVF-ET）
单精子卵泡浆内注射技术（ICSI）
3.多胎妊娠减胎术
4.胚胎和配子（精子和卵子）冷冻技术
5.睾丸和附睾采精技术
6.囊胚培养和冷冻技术
7.胚胎的辅助孵出技术、卵子激活技术
三、复发性流产诊治
1.开展先兆流产的保胎治疗
2.各种难治性复发性流产的系列检查
3.复发性流产的系统保胎治疗
四、生殖内分泌疾病诊治
女性生殖内分泌疾病的诊治，如多囊卵巢综合征、子宫内膜异位症、高泌乳素血症、低促性腺性闭经等。